Neste jogo tem de assumir o controlo do Doutor e tentar encontrar a chave do tempo. A história consiste em recolher as 6 peças da chave do tempo largadas por um dos muitos oponentes que encontra em cada nível.
O Doutor tem apenas uma arma à sua disposição, a sua chave de fendas sónica de confiança, que congela todos os inimigos no nível durante alguns segundos. O Doutor pode enganar monstros para que estes se colidam uns com os outros ao tentarem atacá-lo. A sua busca também é dificultada pelo mestre, que aparece aleatoriamente ao longo do jogo e rouba as peças da chave do tempo, matando-o ao mesmo tempo. Felizmente tem 7 vidas e cada vez que morre regenera numa encarnação diferente e tem companheiros para o ajudar que são controlados pelo jogador 2.
