Blue Boy é um híbrido de beat-em-up e shoot-em-up, e é um pioneiro do moderno jogo de "defesa da torre". Os jogadores assumem o papel do super-herói voador 'Blue Boy' e voam à volta do mundo para impedir ataques alienígenas às grandes cidades.
O objectivo de cada nível é impedir os alienígenas de raptar residentes a vaguear pelo nível; o Blue Boy pode voar livremente pelo nível e usar armas como murros e lasers para eliminar a ameaça alienígena. Se os alienígenas conseguirem capturar um humano, o jogador deve eliminar rapidamente o capturador antes que ambos voem para fora do nível. Os inimigos podem aparecer em qualquer lugar, pelo que, tal como no 'Missile Command', a ordem de resposta deve ser cuidadosamente considerada. Alguns alienígenas atacarão directamente o jogador em vez de raptar humanos. Os humanos que são libertados dos seus raptores são libertados dos seus casulos e ganham bónus tais como armas adicionais, bombas inteligentes e vidas extra, mas ao fazê-lo podem ser distraídos por outros raptos em curso.
Uma vez que todos os alienígenas tenham sido eliminados e não restem humanos, o ataque está completo. Cada cidade tem duas ondas de ataque e um chefe a combater com uma nave espacial. O jogo termina quando o Blue Boy é eliminado ou todos os humanos são raptados; um mini-mapa semelhante ao Defender permite aos jogadores manterem-se a par dos alienígenas e humanos no nível.
