Most Certainly Not Pool II não é um jogo de bilhar. É um jogo de um único jogador baseado em três bolas em algum tipo de mesa, mas não é um jogo de bilhar. É mais um puzzle com bolas limitado no tempo do que um jogo de bilhar. Numa área de jogo rectangular há uma bola vermelha, uma bola azul, um buraco vermelho, um buraco azul e uma bola branca acinzentada. O objectivo é afundar a bola vermelha no buraco vermelho, a bola azul no buraco azul, ou ambas as bolas nos seus respectivos buracos utilizando a bola branca.
A bola branca é controlada com as setas do teclado. Quanto mais tempo uma chave for mantida em baixo, mais rápido ela se moverá numa determinada direcção. O tempo é limitado e para passar ao próximo nível é necessário fazê-lo antes que o tempo se esgote. São marcados pontos por fazer um cesto e é atribuído um bónus pelo tempo restante no relógio, que se transforma numa penalização se o tempo tiver expirado e se tornar negativo. O jogo é inteiramente controlado com o teclado. Não há possibilidade de salvar o jogo, mas existe uma tabela de pontuação.