Blue Boy es un híbrido de beat-em-up y shoot-em-up, y es un pionero del moderno juego de "defensa de torres". Los jugadores asumen el papel del superhéroe volador "Blue Boy" y vuelan por todo el mundo para detener los ataques alienígenas en las principales ciudades.
El objetivo de cada nivel es impedir que los alienígenas secuestren a los residentes que deambulan por el nivel; Blue Boy puede volar libremente por el nivel y utilizar armas como puñetazos y láseres para eliminar la amenaza alienígena. Si los alienígenas consiguen capturar a un humano, el jugador debe eliminar rápidamente al captor antes de que ambos salgan volando del nivel. Los enemigos pueden aparecer en cualquier lugar, por lo que, al igual que en 'Missile Command', hay que considerar cuidadosamente el orden de respuesta. Algunos alienígenas atacarán directamente al jugador en lugar de secuestrar a los humanos. Los humanos que son liberados de sus secuestradores son liberados de sus capullos y ganan bonificaciones como armas adicionales, bombas inteligentes y vidas extra, pero al hacerlo pueden ser distraídos por otras abducciones en curso.
Una vez que todos los alienígenas han sido eliminados y no queda ningún humano, el ataque se ha completado. Cada ciudad tiene dos oleadas de ataque y una batalla de jefe con una nave espacial. El juego termina cuando el Chico Azul es eliminado o todos los humanos son secuestrados; un minimapa similar al de Defender permite a los jugadores hacer un seguimiento de los alienígenas y los humanos en el nivel.
