Scorpius es un juego de disparos de desplazamiento horizontal en el que el jugador puede elegir controlar una de las tres naves espaciales disponibles en su camino a través de planetas exóticos poblados por razas alienígenas hostiles. Las naves varían en forma y utilizan versiones modificadas de tipos de armas básicas. Cada nave comienza con un arma de bajo daño y puede mejorar y cambiar el arma a fuego de dispersión, ataque de rayo lento pero potente, y otros. Las naves también están equipadas con una cola en forma de garra, que se activa con un botón independiente. La cola puede atacar a los enemigos con movimientos circulares y se retrae hacia la nave. La mayoría de las fases requieren alternar entre las armas de fuego y la cola para completarlas con éxito.
