Blue Thunder est un jeu de tir à défilement latéral, lié à la série télévisée éphémère du même nom, dans lequel vous pilotez un nouveau "jetcopter" en tant que seul survivant d'un assaut alien.
Si vous réussissez, vous pouvez réessayer à un niveau de difficulté supérieur, où vous affronterez des ennemis à la cadence de tir plus élevée, des avions, des ballons de barrage et des sous-marins armés de missiles. En attendant, vous devrez garder un œil sur votre réserve de carburant qui s'amenuise. Votre jetcopter peut tirer à n'importe quel angle de vol, même directement vers le bas.
La version C64 défile à l'envers et présente quelques différences mineures dans les graphismes de l'environnement. La version Atari 8-Bit a été rééditée plus tard avec une nouvelle licence de série télévisée (Airwolf) et un nouveau modèle d'hélicoptère.