Dans The Challenge of the Matrix le joueur contrôle une balle dans les quatre directions cardinales sur un terrain de tuiles carrées. Le but est d'éliminer toutes les tuiles en roulant dessus. Évitez de rouler sur un espace vide, car la barre d'énergie de la balle diminue. Une fois l'énergie épuisée, le jeu est terminé. Les niveaux suivants introduisent des obstacles, des tuiles avec des effets spéciaux et des tuiles sur lesquelles vous devez rouler plusieurs fois pour les faire disparaître.
