Sei stato risvegliato troppo tardi dall'animazione sospesa per salvare la tua nave dallo schianto su uno strano pianeta. Ora sta a te salvare i tuoi compagni di equipaggio trovando le capsule di plasma di riserva e lasciando questo pianeta ostile. Volate con la vostra astronave sulla superficie del pianeta e nei tunnel sotterranei cercando di trovare i baccelli. Ci sono vari droidi e ostacoli che cercano di distruggere te e la tua nave, ma tu puoi ucciderli con il tuo blaster. Sulla nave principale hai accesso a un computer di bordo per aiutarti.
Zone Trooper è uno sparatutto a schermo laterale. Oltre all'area di gioco principale, puoi vedere il tuo tempo, l'oggetto che hai, il punteggio e il tuo stato, che mostra aria, energia e potenza. Si può usare un joystick o una tastiera.