Challenger è uno sparatutto a scorrimento laterale con somiglianze a Scramble e Defender. Come nel primo, il giocatore pilota un'astronave su un terreno pieno di installazioni nemiche, ma come nel secondo il giocatore può cambiare direzione e volare sia a destra che a sinistra. L'obiettivo di ogni livello è quello di liberare il terreno e questo può essere fatto sparando raggi laser direttamente o lanciando bombe. Il carburante è limitato e deve essere ricaricato lanciando bombe nei serbatoi. Se ci metti troppo tempo a liberare il terreno, gli alieni mutano e inseguono il giocatore. Altre cose a cui fare attenzione sono i razzi, le pepite e i quad. I quad appaiono al livello 2 e al livello 3 iniziano a far cadere dei pips. Una quantità limitata di scudi può essere utilizzata per proteggersi.
