Flotte di navi aliene si stanno rapidamente avvicinando alla Space Fortress! Sono schiaccianti e non c'è possibilità di vittoria. Tuttavia, possono essere trattenuti il più a lungo possibile. Le armi della Space Fortress ne distruggeranno il più possibile.
Space Fortress è uno sparatutto spaziale statico. Il giocatore si siede ai comandi della Space Fortress e può passare dalla gestione degli obiettivi (armi), all'allocazione dell'energia, al controllo dei danni, al recupero dei powerup e all'utilizzo dei powerup. In ogni momento, l'immagine del radar sarà visualizzata sullo schermo per mostrare qualsiasi nave nemica in avvicinamento. Prendendo il controllo delle armi, il giocatore può sparare ai nemici usando diversi tipi di armi. Ognuno di loro consuma energia, e i colpi dei nemici esauriscono lo scudo della Space Fortress. I nemici sconfitti lasciano dei potenziamenti che devono essere recuperati con le sonde e riportati alla Space Fortress per essere utilizzati. Il gioco finisce quando la Space Fortress viene sconfitta: o perché il suo reattore diventa critico, o perché perde tutto il suo ossigeno e il supporto vitale.
