Scorpius è uno sparatutto a scorrimento orizzontale in cui il giocatore può scegliere di controllare una delle tre astronavi disponibili sulla loro strada attraverso pianeti esotici popolati da razze aliene ostili. Le navi variano nella forma e usano versioni modificate di tipi di armi di base. Ogni nave inizia con un'arma a basso danno e può aggiornare e cambiare l'arma in fuoco sparso, lento ma potente attacco a fascio, e altri. Le navi sono anche dotate di una coda ad artiglio, che si attiva con un pulsante separato. La coda può attaccare i nemici con movimenti circolari e si ritrae verso la nave. La maggior parte delle fasi richiede di alternare le armi da fuoco e la coda per completare con successo.
