Nodes of Yesod」では、月で発見されたモノリスが、地球の安全保障に不可欠なデータを異星人の惑星に転送していた。モノリスの破壊に失敗した後、モノリスはその生みの親であるアリアタン家に運ばれた。チャーリーは惑星アリアットに行き、アリアット人がデータにアクセスするのを阻止することになった。
Arc of Yesodのゲーム性は、前作と非常によく似ています。横スクロールの視点で、チャーリーは、敵や転送装置で満たされた多くの大きな洞窟を探索し、モノリスを永遠に破壊するのに役立つと期待される8つのクリスタルを見つけなければなりません。敵を排除するために、彼は再び「Nodes of Yesod」のモグラに似た装置を操作することができる。ジョイスティックを上に押すと小さな球体が出てきて、(チャーリーが止まっている間に)画面内を移動したり、敵を撃ったりすることができます。また、球体に耐性のある敵もいて、宇宙人は触るとチャーリーのクリスタルを1つ落としてしまいます。