Flying Froggies to sterowana za pomocą klawiatury gra dla jednego gracza, w której gracze biegną przez serię poziomów, aby zebrać monety, zabić wszystkie potwory i odblokować wyjścia. Poziomy przypominają "kosmiczny labirynt" i wszystkie mają ograniczenia czasowe. Potwory zabija się, uderzając w nie zieloną pożywką, która je unieruchamia, dzięki czemu gracz może je zepchnąć z drogi w głębiny poniżej.
Gra zawiera dźwięk, muzykę oraz tabelę najlepszych wyników i może być rozgrywana w trybie okienkowym lub pełnoekranowym.