Foi despertado demasiado tarde da animação suspensa para salvar a sua nave de se despenhar num planeta estranho. Agora cabe-lhe a si salvar os seus companheiros de tripulação, encontrando cápsulas de plasma de reserva e saindo deste planeta hostil. Voa a sua nave espacial sobre a superfície do planeta e para túneis subterrâneos, tentando encontrar as cápsulas. Há vários dróides e obstáculos que tentam destruí-lo a si e à sua nave, mas pode matá-los com o seu detonador. No navio principal, tem acesso a um computador de bordo para o ajudar.
Zone Trooper é um atirador de ecrã lateral. Para além da área de jogo principal, pode ver o seu tempo, o item que tem, a pontuação e o seu estado, que mostra ar, energia e potência. Pode usar um joystick ou um teclado.
