マスターシステム版「Where in the World is Carmen Sandiego?は、コンピュータ版のゲームメカニズムを踏襲しています。主な違いはインターフェイスで、テキストメニューを操作するのではなく、横スクロールの街中でプレイヤーが直接探偵を操作します。目印は、建物(入ると尋問ができる)と、容疑者の特徴を入力する電話ボックス(目の色は車の色で代用)の2つ。プレイヤーが正しい方向に進んでいると、容疑者が現れて銃を撃つことがあります。プレイヤーは時間を忘れないように、容疑者を飛び越えなければなりません。